L'Arche de Noé s'avérait être un grimoire devant sceller les âmes perdues qui répandent le Mal : les Anima. Tombée sous leur emprise, Pandora les libéra du grimoire. Toah, son frère jumeau, voyage désormais avec J, son fidèle acolyte, afin de retrouver les Anima et les emprisonner à nouveau dans l'Arche ! Il espère ainsi pouvoir libérer sa sœur jumelle de l'emprise des forces du Mal...