Alors que Imm pensait avoir enfin créé un monde de paix où chacun serait heureux, sa rencontre avec Mizuha va tout faire basculer.
Après avoir frôlé la mort, Nene et Kô sont parvenus à maîtriser le mystère numéro deux grâce à l'aide de Hanako.
La petite gardienne de l'horloge n'en fait qu'à sa tête et transforme les élèves en vieilles personnes toutes ridées !
Attirés de façon inexplicable, Mitsuha & Taki vont tout faire pour se retrouver bien que le temps et l’espace semblent les séparer…
À l’aide des photos qu’il a vues à l’exposition Nostalgie, Taki essaie de retrouver l’endroit où Mitsuha pourrait vivre dans l’espoir de partir la retrouver…